生物工程系是我院骨干系之一，系内下设生物技术、中草药栽培与鉴定、蔬菜生产与营销和专业基础四个教研室，有中药材、生物技术、蔬菜、植物保护和植物生理五个实验室，同时系内办有承德燕山农业综合服务中心和承德燕山中药材栽培与开发研究所两个自主经营与产、学、研结合的科研实体。生物工程系教学科研力量雄厚，有专兼职教授、副教授14人、讲师5人。其中享受国家及省、市政府津贴者5人次，有省、市科学技术专家10人，河北省农作物品种审定专家1人，承德市专业技术拔尖人才3人。设有中草药栽培与鉴定、生物技术应用、蔬菜生产与营销、植物保护与检验和农学等五个专业，本年度有三个专业招生。

    近些年来，全系教师有5项教学成果获省、市优秀教学成果奖，在国内首次探索出了适于当前教学特点的“滚动式教学模式”，提高了学生的动手能力和综合素质。发表教育教学研究论文四十多篇，二十多篇获国家及省市优秀论文一、二、三等奖；先后承担和参加了三十多项科研课题，获国家及省市科研成果二十多项，十几项获省市科技进步奖，其中“黄芩主要成分——黄芩苷积累规律研究”居国际领先水平，获河北省科技进步三等奖和承德市科技进步一等奖，“冀北糜黍品种资源收集整理及研究利用”获河北省山区创业三等奖、承德市科技进步一等奖和市科学技术市长特别奖。“承谷10号”、“冀黍1号”已通过国家审定，正在省内推广。全系教师主\参编各级教材和编著出版著作二十多部上百万字。我系与三北种业、北京金色农华种业科技有限公司、中国农科院、中国医科院、河北金田种业科技有限公司等有稳定的人才和就业合作关系，就业渠道畅通，2004届64名毕业生已全部安排完毕，毕业生供不应求。